西瓜为雌雄异花同株作物，自然授粉易受天气、昆虫数量等因素影响，坐瓜率不稳定，且果实畸形率较高；人工辅助授粉可提高坐瓜率，但要保证授粉充足且均匀，否则容易出现畸形瓜。有种植户因管理不当，开花授粉间隔时间过长，使西瓜成熟期不一，质量不佳。
选留距主根1米左右处主蔓上的第2朵或第3朵雌花授粉，一般在15节-25节。晚熟品种及多蔓整枝的，留瓜节位适当高些；早熟品种与密植少蔓整枝的，留瓜节位适当低些。如果坐瓜节位偏低、叶数不足，果实发育不良；如果坐瓜节位偏高，容易出现厚皮瓜、大头瓜等畸形瓜。西瓜花粉萌发最适宜温度为23℃-27℃，相对湿度为70%-80%，因此授粉时选择晴天上午9点-10点，此时是雌花柱头和雄花花粉生理活动最旺盛的时候，也是人工授粉的最佳时间。具体做法是，选用发育良好的雄花将花粉均匀涂抹在雌花的三瓣柱头上，操作时，手不能触及果柄和子房，更不能触及柱头，涂抹要全面。为保证西瓜坐瓜整齐、集中采收，授粉时间应在7天之内完成。遇到连阴天时，应采用对花、喷花相结合的办法，确保坐瓜率。授粉后5天-7天，观察雌花发育情况，若子房开始膨大、花柄弯曲下垂，说明授粉成功；若子房未膨大且逐渐萎缩，需及时补授粉或排查原因。授粉成功后10天内，不要喷施高浓度农药，防止影响果实早期发育。授粉后，花粉管发育、完成受精也需要一定条件，此时温度不宜过高。授粉期间，棚内温度白天不要超过30℃、夜间不低于15℃，有利于西瓜授粉、坐瓜，减少畸形瓜。棚内温度达到30℃后，及时通风降低棚温。
